Beskriv de forskellige vilkår gennem tarmsystemet og hvordan de påvirker hvilke bakterier der lever hvor

Generelt består tarmmikrobiomet af 98% bakterier fra rækkerne (phylum) Firmicutes, Bacteroides og Proteobakteria Spiserør: Prevotella (slægt) Streptococcus (slægt) Veilonella (slægt) Mave:Mikroorganismer der kan leve ved meget lav pH, dog holder pH alligevelmikroorganismerne nede så der ikke kommer så mange. Flest Bacteroides (Prevotella (slægt), anaerob)Firmicutes (Streptococcus, Veillonella (gram-)Lactobacillus (mælkesyrebakterie)) Start tyndtarm (duodenum): Minder om bakterierne i maven da pH stadig er meget lav Midt tyndtarm (jejenum): Celleantal af mikroorganismer stiger (fordi pH stiger, selvom mængden af oxygen falder) Enterococcus (slægt) Lactobacillus (slægt) Slut tyndtarm (illeum): Celleantal af mikroorganismer stiger yderligere (fordi pH stiger endnu mere, selvom mængden af oxygen stadig falder) Minder mere og mere om bakteriekulturen i tyktarmen Tyktarm:methanogener + e. coli som bruger det sidste ilt og gør miljøet anoxisk. Store mængder bakterier og en smule methanogener (arkæer) E.coli (fakultativ aerob) som er tilstede i mindre mængder bruger det resterende ilt så miljøet her bliver anoxisk. Dette fremmer vækst af obligate anaerobe arter af Clostridium og Bacteroides.