Sỏi vi khuẩn do Proteus, Pseudomonas, Klebsiella, Staphylococcus được hình thành do chúng tiết ra 2 loại men:

1. Urease: urea thành NH3 và CO2 --> Kiềm hóa nước tiểu --> Ca3(PO4)2 kết tủa. 2. Protease gây viêm tại niệu mạc đài bể thận. --> tạo lõi tế bào chết.