Bệnh cầu thận màng khi quan sát dưới kính hiển vi điện tử sẽ có 4 giai đoạn bao gồm:

Giai đoạn 1: Lắng đọng đặc (mũi tên) dưới tế bào biểu mô, không kèm phản ứng của màng đáy kế cận. Giai đoạn 2 : Màng đáy cầu thận nhô ra có hình gai, cạnh lắng đọng phức hợp miễn dịch. Giai đoạn 3 : Màng đáy bao bọc phức hợp miễn dịch. Giai đoạn 4 : Màng đáy dày, không đều.